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# PAM250 matrix used by Gribskov and Burgess NAR 14(16): 6745-6763
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   A    B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
A  15   2   3   3   3  -5   6  -1   0   0  -1   0   2   5   2  -3   4   4   2  -8  -3   2
B  2  11  -4  11   6  -6   6   4  -2   4  -5  -3  11   1   5   1   3   2  -2  -6  -3   6
C  3  -4  15  -5  -6  -1   2  -1   2  -6  -8  -6  -3   1  -6  -3   6   2   2 -12  10  -6
D  3  11  -5  15  10 -10   6   4  -2   3  -5  -4   6   1   6   0   2   2  -2 -11  -5   8
E  3   6  -6  10  15  -6   5   4  -2   3  -3  -2   5   1   6   0   2   2  -2 -11  -5  11
F -5  -6  -1 -10  -6  15  -6  -1   6  -6  12   5  -5  -6  -8  -5  -3  -3   2  12  13  -6
G  6   6   2   6   5  -6  15  -2  -3  -1  -5  -3   4   3   2  -3   6   4   2 -10  -6   3
H -1   4  -1   4   4  -1  -2  15  -3   1  -2  -3   5   2   6   5  -2  -1  -3  -1   3   5
I  0  -2   2  -2  -2   6  -3  -3  15  -2   8   6  -3  -2  -3  -3  -1   2  11  -5   1  -2
K  0   4  -6   3   3  -6  -1   1  -2  15  -3   2   4   1   4   8   2   2  -2   1  -6   4
L -1  -5  -8  -5  -3  12  -5  -2   8  -3  15  12  -4  -3  -1  -4  -4  -1   8   5   3  -2
M  0  -3  -6  -4  -2   5  -3  -3   6   2  12  15  -3  -2   0   2  -3   0   6  -3  -1  -1
N  2  11  -3   6   5  -5   4   5  -3   4  -4  -3  15   0   4   1   3   2  -3  -3  -1   4
P  5   1   1   1   1  -6   3   2  -2   1  -3  -2   0  15   3   3   4   3   1  -8  -8   2
Q  2   5  -6   6   6  -8   2   6  -3   4  -1   0   4   3  15   4  -1  -1  -2  -5  -6  11
R -3   1  -3   0   0  -5  -3   5  -3   8  -4   2   1   3   4  15   1  -1  -3  13  -6   2
S  4   3   6   2   2  -3   6  -2  -1   2  -4  -3   3   4  -1   1  15   3  -1   3  -4   0
T  4   2   2   2   2  -3   4  -1   2   2  -1   0   2   3  -1  -1   3  15   2  -6  -3   1
V  2  -2   2  -2  -2   2   2  -3  11  -2   8   6  -3   1  -2  -3  -1   2  15  -8  -1  -2
W -8  -6 -12 -11 -11  12 -10  -1  -5   1   5  -3  -3  -8  -5  13   3  -6  -8  15  11  -8
Y -3  -3  10  -5  -5  13  -6   3   1  -6   3  -1  -1  -8  -6  -6  -4  -3  -1  11  15  -6
Z  2   6 -16   8  11  -6   3   5  -2   4  -2  -1   4   2  11   2   0   1  -2  -8  -6  11
